A son çalışma tanımlar the Çin'in Hubei eyaletindeki pnömoni salgınından sorumlu yeni koronavirüs— yarasa kökenli virüs, bilinen diğer patojenik koronavirüslerle ilişkilidir
The 2019 Yeni koronavirüs (CoV), 1300'den fazla onaylanmış enfeksiyon vakası ile 52000'den fazla can iddiasında bulunan ölümcül pnömoniye neden olur. 13 Şubat 2020, hepsi bir aydan biraz fazla bir süre içinde. Peki ama bu virüs nedir? Tamamen yeni bir virüs mü? Nereden geldi? Çin'deki en iyi araştırma enstitülerinden bilim adamları bu soruları yanıtlamak için bir araya geldi ve bu öncü çalışma şu anda yayınlandı. Çin Tıp Dergisi.
https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs
Aralık ayı başlarında Çin'in Hubei eyaletindeki Wuhan şehrinde birkaç kişi yerel bir deniz ürünleri pazarına gittikten sonra hastalanmaya başladı. Öksürük, ateş ve nefes darlığı gibi semptomlar ve hatta akut solunum sıkıntısı sendromu (ARDS) ile ilgili komplikasyonlar yaşadılar. Anında teşhis pnömoniydi, ancak kesin nedeni açıklanamadı. Bu yeni salgına ne sebep oldu? Şiddetli akut solunum sendromu (SARS)-CoV mu? Orta Doğu solunum sendromu (MERS)-CoV mu? Görünüşe göre bilim adamları, ilk birkaç vakayı analiz ettikten sonra Aralık ayında bu virüsü tanımlamak için bir çalışma üstlenmişlerdi. Bu çalışma şu anda yayınlanmaktadır. Çin Tıp Dergisi ve virüsün kimliği belirlendi - yarasa SARS benzeri CoV ile yakından ilişkili, tamamen yeni bir virüs. Araştırmanın baş araştırmacısı Dr. Jianwei Wang (Çin Tıp Bilimleri Akademisi, Patojen Biyolojisi Enstitüsü), “Makalemiz, şimdiye kadar bilinmeyen yarasa kökenli CoV'nin kimliğini belirledi.başlıklı bir kılavuz yayınladı
Bu çalışmada, Çin Tıp Bilimleri Akademisi, Patojen Biyoloji Enstitüsü, Çin-Japonya Dostluk Hastanesi ve Pekin Birliği Tıp Fakültesi gibi Çin'deki ünlü araştırma enstitülerinden bilim adamları, ortaklaşa yeni CoV'yi keşfettiler ve tanımladılar. Wuhan salgını—yeni nesil dizileme (NGS) ile. Wuhan'daki Jin Yin-tan Hastanesine başvuran ve çoğu Wuhan'daki Huanan Deniz Ürünleri Pazarında çalışan beş hastaya odaklandılar. Bu hastalarda yüksek ateş, öksürük ve diğer semptomlar vardı ve başlangıçta nedeni bilinmeyen pnömoni teşhisi kondu. Bazı hastaların durumu hızla ARDS'ye dönüştü; hatta biri öldü. Dr Wang, “Hastaların göğüs röntgenlerinde pnömoniye özgü bazı bulanık opasiteler ve konsolidasyonlar görüldü. Ancak zatürreye neyin sebep olduğunu bulmak istedik ve sonraki deneylerimiz kesin sebebi ortaya çıkardı.— daha önce bilinmeyen yeni bir CoV.başlıklı bir kılavuz yayınladı
Çalışma için bilim adamları, hastalardan alınan bronkoalveolar lavaj (BAL) sıvı örneklerini kullandılar (BAL, steril sıvının bir bronkoskop aracılığıyla akciğerlere aktarıldığı ve daha sonra analiz için toplandığı bir prosedürdür).
İlk olarak, bilim adamları, NGS teknolojisini kullanarak genom dizilimi yoluyla virüsü tanımlamaya çalıştılar. NGS, numunedeki bilinen tüm patojenik mikroorganizmaları hızlı bir şekilde saptayıp ekarte ettiği için bilinmeyen patojenleri belirlemek için tercih edilen tarama yöntemidir. BAL sıvı örneklerinden DNA/RNA dizilimine dayanarak, bilim adamları viral okumaların çoğunun CoV ailesine ait olduğunu buldular. Bilim adamları daha sonra CoV'lere ait farklı "okumaları" bir araya getirdiler ve yeni virüs için tam bir genomik dizi oluşturdular; bu diziler tüm hasta numuneleri arasında %99.8-99.9 benzerdi ve bu virüsün tüm hastalarda ortak patojen olduğunu doğruladı. Ayrıca, bir genom dizisinin bilinen diğer genom dizileriyle karşılaştırıldığı homoloji analizini kullanarak ("yeni" bir dizi olarak kabul edilmesi için önceden ayarlanmış %90 eşiği ile), bu yeni virüsün genom dizisinin %79.0 olduğunu doğruladılar. SARS-CoV'a benzer, MERS-CoV'a yaklaşık %51.8 ve Çin at nalı yarasalarından (ZC87.6 ve ZXC87.7 olarak adlandırılan) diğer SARS benzeri CoV'lere yaklaşık %45-21 benzer. Filogenetik analiz, elde edilen beş CoV suşunun dizilerinin yarasadan türetilen suşlarınkine en yakın olduğunu, ancak ayrı evrimsel dallar oluşturduğunu gösterdi. Bu bulgular, virüsün yarasalardan kaynaklandığını açıkça göstermektedir. Dr Wang, “Viral replikaz geninin bilinen diğer tüm "benzer" virüslerle benzerlikleri hala %90'dan az olduğundan ve filogenetik analiz sonuçlarını da hesaba kattığımızda, bunun gerçekten yeni, önceden bilinmeyen bir CoV olduğunu düşünüyoruz. Bu yeni virüs geçici olarak 2019 olarak adlandırılıyor.-ncov.başlıklı bir kılavuz yayınladı
Son olarak bilim adamları, sıvı örneklerinin laboratuvardaki hücre hatlarına sitopatik etki gösterip göstermediğini kontrol ederek virüsü BAL sıvı örneklerinden “izole etmeye” geçtiler. Sıvı örneklerine maruz kalan hücreler bir elektron mikroskobu altında gözlemlendi ve bilim adamları karakteristik CoV benzeri yapılar buldular. Ayrıca, floresan boyalarla etiketlenmiş spesifik antikorları kullanan bir teknik olan immünofloresan kullandılar. Bunun için, hücrelerin içindeki viral partiküllerle reaksiyona giren, iyileşen hastalardan (antikorlar içeren) alınan serumu kullandılar; bu, bu virüsün gerçekten de enfeksiyonun nedeni olduğunu doğruladı.
Bu çalışma, özellikle hızlı yayılımı, ölümcül ARDS'ye neden olma yeteneği ve salgının neden olduğu panik göz önüne alındığında, virüsün ve kaynaklarının daha iyi anlaşılması için gelecekte yapılacak çalışmaların önünü açmaktadır. Bu virüsün tespit edildiği 4 hastadan 5'ünün Wuhan'daki bir deniz ürünleri pazarından olmasına rağmen, enfeksiyonun kesin kaynağı bilinmiyor. CoV, SARS-CoV (hurma misk eti) veya MERS-CoV (deve) durumunda olduğu gibi “ara” bir taşıyıcı yoluyla insanlara bulaşmış olabilir. Dr Wang şu sonuca varıyor:Tüm insan CoV'leri zoonotiktir ve birkaç insan CoV'si, SARS- ve MERS-CoV'ler dahil olmak üzere yarasalardan kaynaklanmıştır. Çalışmamız, yarasa kaynaklı CoV'lerin insanlara bulaşmasının düzenli olarak izlenmesine olan acil ihtiyacı açıkça göstermektedir. Bu virüsün ortaya çıkması halk sağlığı için büyük bir tehdittir ve bu nedenle daha büyük ölçekli bir salgına tanık olmadan önce bu virüsün kaynağını anlamak ve sonraki adımlara karar vermek kritik önem taşımaktadır.".
