ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri (CDC), SARS-CoV-2 dizi verilerinin kamu alanına yayılmasını hızlandıracak ulusal bir dizileme laboratuvarları ağını başlatmak için bir konsorsiyum başlattı. Açık koronavirüs dizisi verilerinin hızlı bir şekilde serbest bırakılması, rehberlik etmeye yardımcı olacaktır Covid-19 halk sağlığı müdahalesi, inovasyon ve keşifleri yönlendirme ve bu ve gelecekteki pandemilerin anlaşılmasını ilerletme.
Bu Halk Sağlığı Acil Müdahalesi, Epidemiyoloji ve Gözetleme (SPHERES) için SARS-CoV-2 Sıralaması kullanımını büyük ölçüde genişletecek olan konsorsiyum bütün genom dizilimi (WGS) COVID-19 virüsünün. SPHERES, ülke genelinde COVID-19 vakalarını ve kümelerini araştıran halk sağlığı müdahale ekiplerine tutarlı, gerçek zamanlı dizi verileri sağlayacaktır.
Bu yeni konsorsiyum, virüsün hem ulusal hem de yerel topluluklarda nasıl yayıldığını daha iyi anlamalarına yardımcı olacak. Daha iyi veriler, halk sağlığı yetkililerinin bulaşma zincirlerini kesmesine, yeni hastalık vakalarını önlemesine ve hayatları korumalarına ve kurtarmalarına yardımcı olacaktır.
“ABD, gelişmiş hızlı genom dizilemesinde dünya lideridir. Kamu, özel, klinik ve akademik halk sağlığı laboratuvarlarımız genelindeki bu koordineli çaba, SARS-CoV-2'nin bulaşmasını, evrimini ve tedavisini anlamada hayati bir rol oynayacaktır. CDC Direktörü Robert Redfield, “Bugün ve yarın hayat kurtarmamıza yardımcı olmak için en iyi, en yetenekli beyinlerimizin birlikte çalıştığından eminim” dedi.
COVID-19 virüsünü geliştikçe izleme
Genomik dizi verileri, COVID-2'a neden olan virüs olan SARS-CoV-19'nin biyolojisi hakkında eşi görülmemiş bir fikir verebilir ve pandeminin değişen manzarasını tanımlamaya yardımcı olabilir. Amerika Birleşik Devletleri'ndeki virüsleri sıralayarak, CDC ve diğer halk sağlığı yetkilileri virüsteki önemli değişiklikleri izleyebilir ve bu bilgileri temas izleme, halk sağlığı azaltma çabaları ve enfeksiyon kontrol stratejilerine rehberlik etmek için kullanabilir.
SPHERES konsorsiyumu, SARS-CoV-2 genom dizilimini ulusal olarak koordine etmek, düzinelerce daha küçük, bireysel çabayı tek, dağıtılmış bir laboratuvar, kurum ve şirket ağında organize etmek için iddialı bir çabadır. Konsorsiyum, federal hükümet, akademi ve özel sektör genelinde 40 eyalet ve yerel halk sağlığı departmanının, birkaç büyük klinik laboratuvarın ve iki düzineden fazla işbirliği yapan kurumun uzmanlığını, teknolojisini ve kaynaklarını bir araya getiriyor.
SPHERES, en iyi uygulamaları ve fikir birliği veri standartlarını oluşturacak, açık veri paylaşımını hızlandıracak ve en son teknolojinin ulusal COVID-19 müdahalesine getirilmesine yardımcı olmak için bir kaynak ve uzmanlık havuzu oluşturacaktır.
KÜRESEL veriler açık, paylaşıldı
Konsorsiyum üyeleri, hızlı açık dizi paylaşımına yönelik bir taahhüdü paylaşır. Tüm faydalı dizi verilerini Ulusal Tıp Kütüphanesi'nin Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi'ndeki (NLM/NCBI), Kuş Gribi Verilerini Paylaşma Küresel Girişimi'ndeki (GISAID) ve diğer halka açık dizi depolarındaki halka açık havuzlara göndermeyi planlıyorlar. Bu, Amerika Birleşik Devletleri genelindeki viral dizi verilerinin halk sağlığı karar verme süreçlerinde hızla erişilebilir olmasını ve her yerde araştırmacılar için ücretsiz olarak erişilebilir olmasını sağlamaya yardımcı olacaktır.
Konsorsiyum üyeleri şunları içerir:
Federal kurumlar ve laboratuvarlar
Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri, Gelişmiş Moleküler Tespitler Ofisi
Argonne National Laboratory
savunma Sağlık Ajansı, Küresel Bulaşıcı Hastalık gözetim
Gıda ve İlaç İdaresi
Lawrence Berkeley Ulusal Laboratuvarı
Los Alamos Ulusal Laboratuvarı
Ulusal Alerji ve Enfeksiyon Hastalıkları Enstitüsü, Genomik ve İleri Teknoloji Ofisi
Ulusal Standartlar ve Teknoloji Enstitüsü
Ulusal Tıp Kütüphanesi Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi
Walter Reed Ordu Araştırma Enstitüsü
Eyalet/yerel halk sağlığı laboratuvarları
Arizona
Kaliforniya
Delaware
Columbia bölgesi
Florida
Hawaii
Maine
Maryland
Massachusetts
Michigan
Minnesota
kuzey Carolina
Kuzey Dakota
Nevada
Yeni Meksika
New York
Utah
Virjinya
Washington
Wisconsin
Wyoming
Akademik enstitüler
Baylor Üniversitesi
Cornell University
Fred Hutchinson Kanser Araştırma Merkezi
Sina Dağı Tıp Fakültesi
New York Üniversitesi
Kuzey Arizona Üniversitesi
Buffalo Üniversitesi
University of California, Berkeley
California, Davis Üniversitesi
University of California, Irvine
University of California, Los Angeles
California Üniversitesi, San Francisco
California Üniversitesi, Santa Cruz
Chicago Üniversitesi
Maryland Üniversitesi
Minnesota Üniversitesi
Nebraska Üniversitesi
New Mexico Üniversitesi
Washington Üniversitesi
Yale Üniversitesi
Kurumlar
Abbott Teşhis
bioMerieux
Renk Genomikleri
Gingko Bioworks
IDbyDNA
-S-Tel
LabCorp
Bir Kodeks
Oxford Nanopore Teknolojileri
Pasifik Biyobilimleri
Qiagen
İş Tanımı
Verily Yaşam Bilimleri
Şirketlerin adları yalnızca bilgi amaçlı verilmiştir ve burada yer almaları, ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri tarafından şirketlerin veya ticari ürünlerinin veya hizmetlerinin onaylandığı anlamına gelmez.
Kar amacı gütmeyen halk sağlığı veya araştırma enstitüleri
Halk Sağlığı Laboratuvarları Derneği
Bill ve Melinda Gates Vakfı
Geniş Enstitüsü
Chan Zuckerberg BioHub
Craig Venter Enstitüsü
Genomik Epidemiyoloji için Halk Sağlığı İttifakı
Scripps Araştırma
Jackson Laboratuvarı
Translasyonel Genomik Araştırma Enstitüsü - Kuzey
Walder Vakfı
Geçtiğimiz altı yıl boyunca, CDC'nin Gelişmiş Moleküler Tespit Ofisi programı, bulaşıcı hastalık sürveyansı ve salgın yanıtı için patojen genomiğinin ve diğer gelişmiş laboratuvar teknolojilerinin kullanımını genişletmek için federal ve eyalet halk sağlığı laboratuvarlarına yatırım yaptı. Mevcut konsorsiyum yatırımı, SARS-CoV-2 pandemisinde hayat kurtarmayı ve ABD ile dünyayı gelecekteki pandemik müdahaleye hazırlamayı amaçlıyor.
Genomik dizileme veya CDC'nin gelişmiş moleküler algılamadaki çalışmaları hakkında daha fazla bilgi edinmek için şu adresi ziyaret edin: https://www.cdc.gov/amd/
